###################################################################### ########################################################################## ### ### ### Tinker --- Software Tools for Molecular Design ### ## ## ## Version 25.6 December 2025 ## ## ## ## Copyright (c) Jay William Ponder 1990-2025 ## ### All Rights Reserved ### ### ### ########################################################################## ###################################################################### ################################################################ Joint Amber-CHARMM Benchmark on Dihydrofolate Reductase in Water 23558 Atoms, 62.23 Ang Cube, 9 Ang Nonbond Cutoffs, 64x64x64 PME ################################################################ Particle Mesh Ewald Parameters : Type Ewald Alpha Grid Dimensions Spline Order Electrostatics 0.5698 64 64 64 5 Polarization 0.5698 64 64 64 5 Restarting Molecular Dynamics Using : dhfr.dyn Molecular Dynamics Trajectory via Modified Beeman Algorithm Random Number Generator Initialized with SEED : 123456789 MD Step E Total E Potential E Kinetic Temp Pres 1 -46208.4226 -67396.1167 21187.6941 301.73 -2468.42 2 -46199.5748 -67430.2614 21230.6866 302.35 -1623.39 3 -46223.3087 -67505.5967 21282.2880 303.08 -340.29 4 -46223.8499 -67564.0716 21340.2216 303.91 815.60 5 -46221.7993 -67565.3911 21343.5918 303.95 1344.46 6 -46212.3245 -67465.5788 21253.2543 302.67 1043.08 7 -46197.9054 -67371.6750 21173.7696 301.54 28.85 8 -46207.1717 -67367.8783 21160.7066 301.35 -1281.01 9 -46221.9040 -67381.3853 21159.4814 301.33 -2291.87 10 -46220.0683 -67350.0764 21130.0081 300.91 -2555.02